Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vps33bP59016 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps33bP59016 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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