Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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