Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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