Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms