Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TpoP35419 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms