Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxraP28700 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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