Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PdgfraP26618 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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