Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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