Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RarbP22605 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RarbP22605 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RarbP22605 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RarbP22605 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RarbP22605 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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