Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P20040 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms