Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms