Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms