Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms