Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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