Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms