Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms