Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms