Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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