Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms