Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms