Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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