Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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