Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn9Q9Z0S7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms