Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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