Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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