Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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