Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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