Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smg9Q9DB90 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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