Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SlirpQ9D8T7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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