Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms