Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms