Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms