Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms