Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnot11Q9CWN7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.4 ms