Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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