Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms