Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Sike1Q9CPR7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Sike1Q9CPR7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sike1Q9CPR7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sike1Q9CPR7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sike1Q9CPR7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sike1Q9CPR7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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