Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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