Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms