Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms