Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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