Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Krcc1Q99JT5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krcc1Q99JT5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms