Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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