Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gipc3Q8R5M0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms