Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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