Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Atg4aQ8C9S8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Atg4aQ8C9S8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg4aQ8C9S8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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