Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms