Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Negr1Q80Z24 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms