Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms