Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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